Ela é objeto de controvérsia em relação à comprovação experimental. Seguradoras, legisladores e organizações beneficentes têm se tornado mais apreensivas quanto à eficácia das psicoterapias. No entanto, pelo menos um ensaio clínico randomizado (ECR) confirmou que a psicoterapia psicodinâmica foi bem-sucedida no tratamento de transtornos depressivos, transtornos de ansiedade, transtorno de estresse pós-traumático, transtorno somatoforme, bulimia nervosa, anorexia nervosa, transtorno de personalidade borderline, transtorno de personalidade do Cluster C e transtornos relacionados ao uso de substâncias. De acordo com pesquisas de processo, o resultado da psicoterapia psicodinâmica está relacionado à aplicação proficiente de métodos terapêuticos e ao progresso de uma coalizão terapêutica.
Além disso, uma meta-análise mostrou que a psicoterapia psicodinâmica de curto prazo (PPPC) produziu efeitos substanciais e amplos para problemas específicos, sintomas psiquiátricos gerais e funcionamento social. Esses efeitos foram constantes e tenderam a aumentar no acompanhamento. Os efeitos da PPPC superaram os dos controles em lista de espera e daqueles em tratamento habitual. Não foram encontradas variâncias entre a PPPC e outras formas de psicoterapia, um achado semelhante aos resultados de outra pesquisa comparável.
Apesar dos encontros decrescentes com a psicanálise freudiana básica por aqueles que migraram para teorias relacionadas a objetos ou psicologias de duas pessoas, alguns terapeutas, como R. Chessick, tentaram restaurar a atenção à importância da obra de Freud tanto para a prática quanto para o treinamento.